Na úvod musím poznamenat, že to, co obvykle chovatelé potkanů chápou pod pojmem „zápis genů“, je velice zjednodušená verze popisu několika málo skutečně existujících genů ovlivňujících mimo jiné barvu srsti zvířat a badatelům v oboru genetika a molekulární biologie by z toho zřejmě vstávaly vlasy na hlavě.
Poznámka: Dále v textu budu používat taková slova jako gen, alela, genotyp. Recesivní, dominantní – pokud nevíte, co to je, doporučuji sekci Jak to funguje?

Slovní zápis genů
Slovní zápis je v celku jednoduchý, obvykle chovatelé vypíšou slovy, co jejich zvíře „nese“ za barvu, tzn. co se jim po daném zvířeti rodí za barvy.
„Naše Žofka je americká modrá a nese minka.“
Znamená to, že po zvířeti v barvě americká modrá se (při vhodném křížení) rodí i minkové. Zápis může vypadat např. takto: „americká modrá (mink gen)“ nebo „american blue (mink g)“.
„Můj sameček nese dumbo uši a oddeye.“
Po samečkovi se tedy někdy rodí dumbo mláďata s různobarevnýma očima. Zapíšeme tedy „dumbo gen, oddeye gen“ popřípadě použijeme zkratky „Dg, Oddg“.
„Ten jejich hnědej hnusák nese béžovou, minka, fawna a topaze.“
V tomto případě napíšeme pouze „hnědý (béžový gen, mink gen)“ neboť barva fawn je aguti varianta béžové barvy a není třeba to vypisovat, barva topaz je aguti varianta barvy vznikající kombinací barvy béžová a mink a tudíž je též zbytečné to vypisovat.
Nevýhoda tohoto popisu je v tom, že zabere spoustu místa, zvlášť pokud zvíře nese barev vícero. Na druhou stranu je vhodný pro značení tvaru těla a typu srsti, protože těch není tolik a obvykle se používá systém zkratek:
U srstí typu rex a velveteen se geny obvykle nevypisují, jelikož se dědí dominantně a je jasné, že pokud je matka rex, některá mláďata budou též rex, bez ohledu na typ srsti samečka.

Systém dohodnutého značení
Systém dohodnutého značení je kratší a relativně mezinárodně srozumitelný, neboť ve většině světa se používá stejný systém značení (výjimkou je např. Británie, viz níže). Pro označení konkrétních barev se používá jedno nebo dvě písmenka latinské abecedy, toto značení převážně vychází z označování těchto genů v odborných kruzích. Pro označování dominantních alel se používají velká písmena, pro alely recesivní písmena malá.
Barvy jsou základní (v tabulce označeny kurzívou) nebo kombinované (k vytvoření kombinované barvy je potřeba více genů). K tomu, aby zvíře mělo určitou základní barvu (výjimkou je perlová barva), potřebuje mít dvě recesivní alely stejného genu. Např. béžové zvíře značíme rr, šampaňské pp, ruské modré dd.
Perlová barva je barva kombinovaná, perlový efekt se na srsti projeví pouze v případě, že zvíře je zároveň mink. Navíc je perlové zbarvení dominantní a smrtelné v případě, že by mládě mělo mít obě dominantní alely (PePe). Tudíž potkan v barvě perlové se zapíše jako mm Pepe. Kombinace recesivních alel pepe nemá vliv na barvu, mm pepe je pořád zvíře v barvě srsti mink.

Přehled genů ovlivňujících barvu:

gen	písmenko	alely
barva srsti (tj. zda to zvíře bude barevné, siam atd.)	c	C c c(h)
aguti (vytváří ticking)	a	A a
čokoládová barva	b	B b
americká modrá barva	g (v Británii d)	G g
ruská modrá barva	d (v Británii rb)	D d
barva americký mink	mo	Mo mo
barva britský mink	m	M m
béžová barva	r	R r
šampaňská barva	p	P p
perlová barva	Pe	Pe pe

Aguti varianty (s tickingem) základních barev vznikají působením genu a, který má dvě alely, dominantní alelu A (pokud je přítomna, vždy způsobí ticking) a recesivní alelu a. Pokud má zvíře dvě recesivní alely aa je černé, popřípadě má jinou barvu, způsobenou dalším genem. Aguti zvíře má kombinaci AA nebo Aa, proto pokud nemáme jistotu, která je ta druhá alela, píšeme A-.
Působením aguti genu vznikají další barvy:

základní barva	zápis	aguti varianta	zápis
černá	aa	aguti	A-
čokoládová barva	aa bb	čokoládová aguti	A- bb
americká modrá barva	aa gg	modrá aguti	A- gg
ruská modrá barva	aa dd	ruská modrá aguti	A- dd
barva americký mink	aa momo	americká skořicová	A- momo
barva britský mink	aa mm	britská skořicová	A- mm
béžová barva	aa rr	fawn	A- rr
šampaňská barva	aa pp	amber	A- pp
perlová barva	aa mm Pepe	skořicová perlová	A- mm Pepe

Z tabulky je vidět, jak barvy převážně utváří dvě recesivní alely. To ale neznamená, že aguti zvíře nemá žádné geny barev, jen vlastní dominantní alely genu, takže se barva neprojeví. Např. Aa GG má dvě dominantní alely genu pro americkou modrou barvu, a jednu recesivní a jednu dominantní alelu aguti genu, tzn. pokud ho vhodně nakryjeme, narodí se po něm černá i aguti zvířata, ale žádné modré. Jiný případ by byl, kdyby potkan měl jednu alelu amerického modrého genu recesivní – Aa Gg. Tady by se po vhodném krytí (např. americkým modrým zvířetem) narodila mláďata v barvách nejen černá a aguti, ale i americká modrá a modrá aguti. O takovém zvířeti bychom tedy řekli, že americkou modrou nese.
Další barvy vznikají kombinací dvou genů základních barev plus aguti genu.

kombinovaná barva	zápis	kombinovaná aguti barva	zápis
barva ruská silver	aa dd gg	ruská silver aguti	A- dd gg
barva ruská dove	aa dd mm	ruská dove aguti	A- dd mm
platinová barva	aa gg mm	platinová aguti	A- gg mm
barva buff	aa rr mm	topaz	A- rr mm
barva silver	aa gg pp	silver aguti	A- gg pp

Existují barvy ještě složitější, na kterých se mohou podílet čtyři a více genů, např. barva ruská platina aa dd gg mm, těm se ale věnovat nebudu. Kromě toho jsou též tzv. hybridní barvy, vznikající tím, že některé alely nejsou plně recesivní a projeví se i v případě, že potkan má jen jednu tuto alelu. Nejznámější z hybridních barev je havana aa Rr mm, kde se recesivní alela béžového genu vyskytuje jen jednou a přesto minka zesvětlí.
Zvláštní skupina barev jsou zbarvení himalájské a siamské a také albín. Tato zbarvení vytváří alely genu c (c jako chinchilla, tak se tento gen odborně označuje). Pokud potkan vlastní alespoň jednu dominantní alelu C, má vždy barvu po celém těle. Pokud vlastní dvě recesivní alely cc, nevytváří barvu na těle nikde, je tedy albín. Albíni mohou mít recesivní alely genů dalších barev, ale v srsti se neprojeví, je tedy jedno jestli je genotyp cc aa DD, cc aa dd, cc Aa Dd, cc Aa dd, zvíře je vždycky albín, ač by např. v případě cc aa dd mělo mít ruskou modrou barvu.
Kromě alel C a c vytváří tento gen ještě alelu c(h), která je recesivní a podílí se na vytváření zvířat ve zbarvení himalájském a siamském, tj. takovém, kdy jsou zbarveny jen okrajové částí těla (nos, uši, čumák, nohy). Potkan s genotypem c(h)c(h) aa dd bude siamský s ruskými modrými znaky, zbarvení himalájské s ruskými modrými znaky vytváří kombinace této alely s recesivní c alelou – cc(h) aa dd. Genotyp Cc(h) aa dd značí ruské modré zvíře, které nese vlohu pro siamské/himalájské zbarvení.
Příklady zápisu různě zbarvených zvířat:

zbarvení zvířete	zápis
Himalájské s mink znaky	cc(h) aa mm
Černé nesoucí ruskou modrou a americkou modrou	CC aa Dd Gg
Skořicové perlové nesoucí ruskou modrou	CC Aa Dd mm Pepe
Amber nesoucí siamské zbarvení	Cc(h) AA pp
Topaz nesoucí amerického minka a albína	Cc Aa rr mm Momo
Čokoládová nesoucí perlovou barvu	CC aa bb Mm Pepe
Ruská silver nesoucí britského minka	C- aa gg dd Mm